Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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