Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms