Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
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