Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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PUM3Q15397 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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