Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms