Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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