Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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ITGA9Q13797 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ITGA9Q13797 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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ITGA9Q13797 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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ITGA9Q13797 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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ITGA9Q13797 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ITGA9Q13797 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ITGA9Q13797 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ITGA9Q13797 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ITGA9Q13797 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ITGA9Q13797 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ITGA9Q13797 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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