Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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