Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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