Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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