Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms