Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AL049646.1-201ENST00000457009 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC097662.1-204ENST00000396588 2214 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 MSANTD3-TMEFF1-201ENST00000502978 2069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AL356432.2-201ENST00000407841 422 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 TMSB10P1-201ENST00000415070 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC114760.1-201ENST00000420310 652 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AL139237.1-201ENST00000446107 513 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 MYADML-203ENST00000491596 951 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 ANAPC15-211ENST00000542531 812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC048344.2-201ENST00000547280 147 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AL160314.2-202ENST00000553792 534 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC138907.5-201ENST00000561744 273 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC015674.1-201ENST00000578482 267 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 RN7SL49P-201ENST00000581392 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC009686.2-201ENST00000607017 577 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 ST7-OT4_3.1-201ENST00000615542 293 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AF228730.7-203ENST00000641436 1804 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 AC010680.2-201ENST00000603521 2117 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 PALLD-206ENST00000505667 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 ZNF85-202ENST00000328178 2296 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXB1P14653 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 TBX5-AS1-201ENST00000528549 3620 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 AP4S1-204ENST00000542754 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 RN7SKP48-201ENST00000365031 328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXB1P14653 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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