Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VPREB1P12018 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms