Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PKHD1P08F94 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
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PKHD1P08F94 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PKHD1P08F94 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
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PKHD1P08F94 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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PKHD1P08F94 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PKHD1P08F94 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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PKHD1P08F94 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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