Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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