Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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ARL2-SNX15V9GYD0 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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ARL2-SNX15V9GYD0 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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