Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.2 ms