Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms