Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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