Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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