Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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