Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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