Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms