Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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