Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3BQ13214 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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