Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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