Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms