Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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GOPCQ9HD26 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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GOPCQ9HD26 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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GOPCQ9HD26 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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GOPCQ9HD26 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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GOPCQ9HD26 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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GOPCQ9HD26 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GOPCQ9HD26 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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