Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms