Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms