Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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