Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRRQ15256 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRRQ15256 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRRQ15256 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRRQ15256 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRRQ15256 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRRQ15256 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRRQ15256 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRRQ15256 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRRQ15256 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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