Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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