Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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