Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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CDH18Q13634 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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CDH18Q13634 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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CDH18Q13634 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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CDH18Q13634 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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