Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms