Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ACTR6-201ENST00000188312 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 XRCC6P4-201ENST00000518193 2067 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 TMEM144-216ENST00000514558 3699 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ZNF35-201ENST00000296092 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 MED23-202ENST00000368053 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 MUC20-204ENST00000445522 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 DNAH10-209ENST00000614082 3484 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC005863.1-201ENST00000379640 2998 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 LINC01915-201ENST00000577994 2321 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 OR51E1-202ENST00000530215 2942 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 UCA1-201ENST00000397381 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms