Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRMP28827 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRMP28827 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRMP28827 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRMP28827 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRMP28827 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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