Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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