Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 ABLIM1-205ENST00000369266 2230 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 OR2A20P-201ENST00000479887 2913 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 HELQ-204ENST00000510985 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 ANKFN1-202ENST00000566473 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRHP20396 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 SLC16A4-206ENST00000472422 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 STXBP5-AS1-209ENST00000606831 2025 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 NOX4-210ENST00000527956 2379 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 FAM9C-201ENST00000333995 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms