Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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