Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms