Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms