Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms