Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms