Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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