Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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