| RUNX3 | Q13761 | ARHGAP21-218 | ENST00000636789 | 4210 nt | TSL 2 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRC3-201 | ENST00000381903 | 798 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-13P-201 | ENST00000384499 | 162 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FCF1P5-201 | ENST00000406490 | 482 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6ATAC34P-201 | ENST00000408879 | 121 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP317-201 | ENST00000410176 | 116 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP311-201 | ENST00000411290 | 116 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TTTY21B-201 | ENST00000421353 | 307 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL158073.1-201 | ENST00000426848 | 1104 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TTTY21-201 | ENST00000430228 | 307 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL34P6-201 | ENST00000432390 | 345 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353764.1-201 | ENST00000442072 | 474 nt | TSL 2 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC234781.1-201 | ENST00000444722 | 459 nt | TSL 3 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL500527.1-201 | ENST00000448532 | 255 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS20P4-201 | ENST00000461659 | 355 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025741.1-201 | ENST00000506100 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097478.1-202 | ENST00000508021 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004704.1-201 | ENST00000511219 | 583 nt | TSL 3 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP230-201 | ENST00000517039 | 122 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP312-201 | ENST00000517068 | 116 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TATDN1-202 | ENST00000517678 | 815 nt | TSL 3 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TATDN1-206 | ENST00000519548 | 889 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009803.3-201 | ENST00000548457 | 540 nt | TSL 3 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359237.1-202 | ENST00000556168 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC106785.1-201 | ENST00000565935 | 262 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC015912.2-201 | ENST00000571053 | 181 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ABHD15-AS1-201 | ENST00000581474 | 187 nt | TSL 5 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC130352.1-201 | ENST00000602979 | 661 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023762.1-201 | ENST00000603280 | 584 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090948.2-201 | ENST00000607363 | 564 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136370.1-201 | ENST00000608166 | 691 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR7M1P-201 | ENST00000608946 | 533 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02266-201 | ENST00000610239 | 1151 nt | TSL 3 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LGALS13-204 | ENST00000621475 | 494 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138965.3-201 | ENST00000623875 | 498 nt | BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136084.2-203 | ENST00000630758 | 690 nt | TSL 5 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TNRC6B-202 | ENST00000335727 | 17933 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CENPE-208 | ENST00000611174 | 8260 nt | TSL 5 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPRD-203 | ENST00000381196 | 9911 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDC16-202 | ENST00000252458 | 1991 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FSBP-203 | ENST00000611249 | 2181 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GYS2-201 | ENST00000261195 | 3132 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF285-204 | ENST00000591679 | 2388 nt | APPRIS ALT2 TSL 4 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DLG1-217 | ENST00000452595 | 3053 nt | TSL 2 BASIC | 4.54 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MOXD1-201 | ENST00000336749 | 2950 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01676-202 | ENST00000435253 | 1849 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RABL3-201 | ENST00000273375 | 3883 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GHR-202 | ENST00000357703 | 4316 nt | TSL 5 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF616-204 | ENST00000600228 | 4335 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GHR-213 | ENST00000622294 | 4312 nt | TSL 5 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PHF11-215 | ENST00000488958 | 1318 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNTD1-205 | ENST00000588527 | 1308 nt | TSL 2 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6C3-202 | ENST00000641364 | 1341 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR51H2P-202 | ENST00000641424 | 3046 nt | BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6B1-202 | ENST00000641698 | 5153 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC139769.1-204 | ENST00000472297 | 1931 nt | BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-819P-201 | ENST00000364116 | 107 nt | BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ESCO2-202 | ENST00000397418 | 720 nt | TSL 5 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-564P-201 | ENST00000410983 | 104 nt | BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP52-201 | ENST00000439311 | 478 nt | BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THUMPD3-AS1-215 | ENST00000521609 | 793 nt | TSL 5 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNHG1-218 | ENST00000541615 | 748 nt | TSL 5 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NELL2-211 | ENST00000548826 | 559 nt | TSL 2 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC051619.4-201 | ENST00000560034 | 292 nt | TSL 5 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC245389.2-201 | ENST00000616023 | 576 nt | BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC242843.1-201 | ENST00000618702 | 573 nt | BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090506.2-201 | ENST00000624521 | 419 nt | BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DLX6-AS1-201 | ENST00000430027 | 15364 nt | TSL 2 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLCO1A2-201 | ENST00000307378 | 7682 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRPC4-205 | ENST00000379679 | 2475 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RASGEF1B-207 | ENST00000509081 | 3016 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPEF2-216 | ENST00000637569 | 7350 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OSBPL11-201 | ENST00000296220 | 4191 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RXFP1-204 | ENST00000423548 | 3930 nt | TSL 2 BASIC | 4.53 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTRNR2L7-201 | ENST00000544824 | 1535 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAMMSON-213 | ENST00000641336 | 1521 nt | BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAP1B-201 | ENST00000250559 | 13438 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TM4SF18-201 | ENST00000296059 | 3852 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FNIP1-201 | ENST00000307954 | 6366 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NAMPT-202 | ENST00000354289 | 1213 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPRR2E-202 | ENST00000368751 | 692 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SRY-201 | ENST00000383070 | 845 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025750.1-201 | ENST00000399891 | 379 nt | BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590609.3-201 | ENST00000411815 | 210 nt | TSL 3 BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01614-201 | ENST00000415479 | 648 nt | TSL 2 BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARAFP1-201 | ENST00000422172 | 605 nt | BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RCC2P2-201 | ENST00000422174 | 918 nt | BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAPRE1P3-201 | ENST00000435438 | 796 nt | BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSFY6P-201 | ENST00000445573 | 403 nt | BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC000124.1-201 | ENST00000448311 | 957 nt | TSL 2 BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNAP25-AS1-205 | ENST00000453544 | 368 nt | TSL 5 BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01150-201 | ENST00000455671 | 315 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL35P6-201 | ENST00000490024 | 372 nt | BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00613-201 | ENST00000504365 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02149-201 | ENST00000511443 | 558 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EQTN-204 | ENST00000537675 | 879 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8R1P-201 | ENST00000543943 | 764 nt | BASIC | 4.52 | □□□□□ -1.69 | | |