Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms