Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 460.7 ms